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会计科目编号是按会计科目表中科目分类排列次序编列的。会计科目的编号是以数字、文字、字母和横线以及圈点等方式进行的。
一个良好会计科目编号系统的要求：
总结西方会计科目编号的理论与实务，一个良好的会计科目编号系统，必须要有一定的章法和合乎逻辑；编号的每一“数码”，须使其具有意义，藉以显示类、项、科、子目的区别，及各科目彼此间的关节联系；以达到类、项、科、子目分类层次分明，系统清晰，准确显示会计科目的内容、性质与意义，以及便于记忆与运用的要求。
概括的说，会计科目的编号，应与会计要素按五大类四个层级划分，设置会计科、子目，及一般认可的大类、项目排列方式相适应；其基本要求及原则应属一致。
1、预定千、百、十、个四位数字，自左至右，分别代表大类（千）、项目（百）和科目（十、个），子目则以“N”予以表示；而相关的附加或抵销科目，则以“—N”予以表示；
2、以千位的1、2、3、4、5、6，分别顺序代表资产类、负债类、共同类、所有者权益类、成本类、损益类等六类；
3、而以百位的1、2、……顺序代表大类之下，项目的分类及固定排列；
4、每个项目之下的科目编号，则从01开始，至99为止；其间复可分段编列不同内容、性质的科目。